Наша компания (Исполнитель) планирует оказывать услуги по разработке технической документации (посредством интернета) и консультации, сопровождение ПО заграницу (в Казахстан).

Местом оказания услуг считается место деятельности Заказчика.
Прошу проконсультировать:

1. Как прописывать ставку и сумму НДС в договоре? 
2. Как отражать НДС в сч/ф?
3. Как заполнять декларацию?
4. Правильно ли я определила место оказание услуг?

Согласно ст. 148 НК РФ место оказания работ (услуг) определяется по месту осуществления деятельности покупателя при:

передаче, предоставлению патентов, лицензий, торговых марок, авторских прав или иных аналогичных прав;

оказании услуг (выполнении работ) по разработке программ для ЭВМ и баз данных (программных средств и информационных продуктов вычислительной техники), их адаптации и модификации;
оказании консультационных, … инжиниринговых… услуг, услуг по обработке информации, а также при проведении научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ.

Если рассматривать формулировку договора в том виде, какой изложен в вашем вопросе, то вы, скорее всего, правы и операции по реализации вышеописанных работ (услуг) не являются объектом одолжения НДС на территории РФ.

При этом, необходимо иметь ввиду, что в ряде случаев налоговые органы трактуют работы по разработке технической документации как подрядные работы, не связанные работами, перечисленными в ст. 148 НК РФ. Поэтому, во избежание такого рода рисков, надо внимательно относится к формулировкам предмета договора, и стремиться к тому, чтобы они максимально близко соответствовали формулировкам, содержащимся в Налоговом Кодексе, и не допускали двоякого толкования.

В случае, когда операции по реализации не являются объектом обложения НДС и у организации отсутствует обязанность по оформлению счета-фактуры, так как при реализации товаров (работ, услуг), не являющихся объектом налогообложения по налогу на добавленную стоимость, счета-фактуры не выставляются и в книге продаж не отражаются (см. Письмо Минфина России от 02.08.2012 N 03-07-09/102).

Сумма НДС в договоре и актах также не выделяется (можно справочно указать, что операция не является объектом обложения НДС).

При заполнении налоговой декларации по НДС согласно Приказу Минфина РФ от 15.10.2009 N 104н "Об утверждении формы налоговой декларации по налогу на добавленную стоимость и Порядка ее заполнения" данная операция должна отражаться в разд. 7 декларации. При его заполнении в графе 2 строки 010 указывается стоимость товаров (работ, услуг), местом реализации которых не признается территория РФ.